Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB38P57729 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB38P57729 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB38P57729 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB38P57729 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB38P57729 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB38P57729 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB38P57729 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB38P57729 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB38P57729 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB38P57729 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB38P57729 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB38P57729 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB38P57729 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB38P57729 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB38P57729 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB38P57729 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB38P57729 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB38P57729 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB38P57729 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB38P57729 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms