Protein–RNA interactions for Protein: P56851

EDDM3B, Epididymal secretory protein E3-beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDDM3BP56851 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDDM3BP56851 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms