Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NME5P56597 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NME5P56597 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NME5P56597 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NME5P56597 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NME5P56597 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NME5P56597 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NME5P56597 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NME5P56597 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NME5P56597 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NME5P56597 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NME5P56597 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms