Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOSBP53539 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOSBP53539 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSBP53539 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSBP53539 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms