Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ETV1P50549 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ETV1P50549 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ETV1P50549 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ETV1P50549 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETV1P50549 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETV1P50549 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETV1P50549 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETV1P50549 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETV1P50549 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETV1P50549 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ETV1P50549 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms