Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IDH3AP50213 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IDH3AP50213 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms