Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP2P50120 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP2P50120 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP2P50120 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP2P50120 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP2P50120 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP2P50120 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP2P50120 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP2P50120 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP2P50120 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP2P50120 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP2P50120 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP2P50120 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP2P50120 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP2P50120 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP2P50120 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP2P50120 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP2P50120 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP2P50120 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP2P50120 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP2P50120 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP2P50120 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP2P50120 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP2P50120 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP2P50120 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP2P50120 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP2P50120 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP2P50120 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP2P50120 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP2P50120 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP2P50120 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP2P50120 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms