Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC1P48995 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms