Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLCP48506 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLCP48506 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLCP48506 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLCP48506 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLCP48506 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLCP48506 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLCP48506 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLCP48506 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLCP48506 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLCP48506 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLCP48506 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLCP48506 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLCP48506 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLCP48506 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLCP48506 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLCP48506 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLCP48506 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLCP48506 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLCP48506 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLCP48506 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GCLCP48506 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GCLCP48506 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
GCLCP48506 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GCLCP48506 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLCP48506 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms