Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ME1P48163 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME1P48163 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME1P48163 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ME1P48163 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms