Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECI1P42126 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECI1P42126 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECI1P42126 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECI1P42126 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECI1P42126 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECI1P42126 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECI1P42126 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECI1P42126 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECI1P42126 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ECI1P42126 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECI1P42126 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECI1P42126 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ECI1P42126 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ECI1P42126 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ECI1P42126 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ECI1P42126 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECI1P42126 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECI1P42126 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms