Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms