Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARGP37231 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGP37231 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms