Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGER4P35408 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms