Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD247P20963 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD247P20963 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD247P20963 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD247P20963 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD247P20963 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD247P20963 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD247P20963 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD247P20963 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD247P20963 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD247P20963 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CD247P20963 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD247P20963 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD247P20963 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD247P20963 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms