Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCNA2P20248 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms