Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2B1P20020 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms