Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPI1P17947 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPI1P17947 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPI1P17947 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPI1P17947 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPI1P17947 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPI1P17947 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPI1P17947 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPI1P17947 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms