Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XBP1P17861 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XBP1P17861 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
XBP1P17861 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
XBP1P17861 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XBP1P17861 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XBP1P17861 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XBP1P17861 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XBP1P17861 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XBP1P17861 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XBP1P17861 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
XBP1P17861 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XBP1P17861 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XBP1P17861 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XBP1P17861 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XBP1P17861 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XBP1P17861 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XBP1P17861 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XBP1P17861 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XBP1P17861 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XBP1P17861 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XBP1P17861 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XBP1P17861 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XBP1P17861 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms