Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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