Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms