Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC166P0CW27 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms