Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC172P0C7W6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms