Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP1P09874 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP1P09874 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP1P09874 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP1P09874 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP1P09874 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP1P09874 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP1P09874 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP1P09874 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP1P09874 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP1P09874 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP1P09874 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP1P09874 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP1P09874 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP1P09874 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP1P09874 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP1P09874 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP1P09874 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP1P09874 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP1P09874 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP1P09874 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP1P09874 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP1P09874 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP1P09874 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP1P09874 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP1P09874 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP1P09874 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP1P09874 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP1P09874 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP1P09874 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP1P09874 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP1P09874 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP1P09874 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP1P09874 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP1P09874 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP1P09874 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP1P09874 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP1P09874 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP1P09874 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms