Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXB7P09629 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB7P09629 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms