Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB1P08034 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB1P08034 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB1P08034 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB1P08034 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms