Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYBBP04839 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYBBP04839 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYBBP04839 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYBBP04839 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYBBP04839 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYBBP04839 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CYBBP04839 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYBBP04839 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYBBP04839 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYBBP04839 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYBBP04839 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYBBP04839 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYBBP04839 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYBBP04839 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYBBP04839 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYBBP04839 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYBBP04839 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYBBP04839 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYBBP04839 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYBBP04839 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYBBP04839 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYBBP04839 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYBBP04839 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYBBP04839 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYBBP04839 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYBBP04839 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYBBP04839 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYBBP04839 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYBBP04839 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYBBP04839 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYBBP04839 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYBBP04839 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms