Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX7O95931 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX7O95931 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX7O95931 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms