Protein–RNA interactions for Protein: O95674

CDS2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS2O95674 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDS2O95674 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDS2O95674 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDS2O95674 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDS2O95674 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDS2O95674 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDS2O95674 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDS2O95674 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDS2O95674 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDS2O95674 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS2O95674 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS2O95674 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS2O95674 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS2O95674 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS2O95674 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS2O95674 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS2O95674 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS2O95674 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS2O95674 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS2O95674 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS2O95674 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS2O95674 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS2O95674 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDS2O95674 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms