Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNAPINO95295 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms