Protein–RNA interactions for Protein: O75976

CPD, Carboxypeptidase D, humanhuman

Predictions only

Length 1,380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPDO75976 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CPDO75976 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPDO75976 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPDO75976 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPDO75976 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPDO75976 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPDO75976 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPDO75976 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPDO75976 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPDO75976 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPDO75976 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPDO75976 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPDO75976 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPDO75976 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPDO75976 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPDO75976 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPDO75976 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPDO75976 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPDO75976 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPDO75976 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPDO75976 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CPDO75976 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPDO75976 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPDO75976 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPDO75976 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPDO75976 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPDO75976 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CPDO75976 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPDO75976 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPDO75976 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPDO75976 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPDO75976 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPDO75976 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPDO75976 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPDO75976 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPDO75976 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CPDO75976 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPDO75976 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPDO75976 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPDO75976 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPDO75976 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPDO75976 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPDO75976 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPDO75976 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPDO75976 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CPDO75976 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPDO75976 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPDO75976 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPDO75976 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPDO75976 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPDO75976 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CPDO75976 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPDO75976 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPDO75976 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPDO75976 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPDO75976 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPDO75976 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPDO75976 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPDO75976 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPDO75976 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPDO75976 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPDO75976 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPDO75976 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPDO75976 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPDO75976 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPDO75976 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPDO75976 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPDO75976 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CPDO75976 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPDO75976 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPDO75976 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPDO75976 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPDO75976 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CPDO75976 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPDO75976 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPDO75976 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CPDO75976 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPDO75976 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CPDO75976 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPDO75976 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPDO75976 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPDO75976 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPDO75976 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPDO75976 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPDO75976 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPDO75976 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPDO75976 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPDO75976 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPDO75976 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPDO75976 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CPDO75976 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPDO75976 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPDO75976 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPDO75976 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPDO75976 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPDO75976 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPDO75976 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPDO75976 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPDO75976 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPDO75976 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms