Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS6KA4O75676 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KA4O75676 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms