Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKAP2O75563 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms