Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms