Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ABCC9O60706 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ABCC9O60706 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms