Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB2O43741 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB2O43741 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms