Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPAA1O43292 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms