Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGFO15240 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VGFO15240 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VGFO15240 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VGFO15240 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VGFO15240 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
VGFO15240 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
VGFO15240 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VGFO15240 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VGFO15240 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VGFO15240 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGFO15240 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VGFO15240 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VGFO15240 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VGFO15240 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VGFO15240 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VGFO15240 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VGFO15240 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VGFO15240 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VGFO15240 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VGFO15240 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VGFO15240 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VGFO15240 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VGFO15240 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VGFO15240 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VGFO15240 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VGFO15240 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VGFO15240 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VGFO15240 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VGFO15240 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VGFO15240 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VGFO15240 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VGFO15240 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VGFO15240 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VGFO15240 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VGFO15240 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VGFO15240 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VGFO15240 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
VGFO15240 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VGFO15240 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VGFO15240 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VGFO15240 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VGFO15240 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
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