Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD1AO15047 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1AO15047 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1AO15047 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1AO15047 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1AO15047 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1AO15047 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1AO15047 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1AO15047 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1AO15047 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1AO15047 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1AO15047 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1AO15047 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD1AO15047 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms