Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARHGEF10O15013 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ARHGEF10O15013 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGEF10O15013 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
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