Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHOX2AO14813 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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