Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms