Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQV1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQV1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQV1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQV1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQV1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQV1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQV1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQV1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQV1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQV1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQV1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQV1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQV1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQV1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQV1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQV1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQV1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BQV1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BQV1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BQV1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BQV1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BQV1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQV1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQV1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQV1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQV1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQV1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQV1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQV1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQV1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQV1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQV1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQV1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQV1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQV1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQV1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQV1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQV1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BQV1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BQV1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BQV1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BQV1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BQV1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BQV1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BQV1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BQV1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BQV1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BQV1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BQV1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BQV1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BQV1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BQV1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BQV1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BQV1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BQV1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BQV1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms