Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGB1P1B2RPK0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms