Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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A0A0J9YXV3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
A0A0J9YXV3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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