Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MYOF-201ENST00000358334 6680 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 SIPA1L2-203ENST00000366630 6690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 XCR1-201ENST00000309285 5281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 TBL1XR1-214ENST00000457928 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RPS10-NUDT3-202ENST00000639725 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 PHC1-214ENST00000544916 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 TIMP2-204ENST00000586057 3389 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 PROM1-210ENST00000510224 4006 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MIER1-201ENST00000355356 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 ALPK1-205ENST00000504176 5203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 GUCY1A2-203ENST00000526355 16205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 PIGN-201ENST00000357637 4723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNMB3-205ENST00000485523 7246 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 BIRC2-213ENST00000613397 4066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 WISP1-202ENST00000250160 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 PXN-206ENST00000458477 3807 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 ABCB1-201ENST00000265724 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC37A6P-202ENST00000448648 5444 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 CARF-213ENST00000438828 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 LMOD1-201ENST00000367288 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF267-201ENST00000300870 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 CSMD1-218ENST00000635120 11737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF185-212ENST00000539731 4334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC129-202ENST00000407970 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRP3-202ENST00000348069 3828 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AVIL-201ENST00000257861 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 C2-201ENST00000299367 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM255A-203ENST00000371369 3425 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 C2CD3-202ENST00000334126 7960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM19A2-201ENST00000416284 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 TANGO6-201ENST00000261778 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 KIF15-201ENST00000326047 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MAP3K7-205ENST00000369332 4830 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 STK36-202ENST00000392105 4821 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 SMYD1-201ENST00000419482 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RHOXF2-201ENST00000371388 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 USP5-202ENST00000389231 3083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 BBS9-204ENST00000396127 3914 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 IL4R-201ENST00000170630 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MYH15-201ENST00000273353 7074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR296-201ENST00000385215 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL745P-201ENST00000484900 299 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 GPRASP2-204ENST00000535209 3847 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005871.2-201ENST00000549104 526 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC093249.5-201ENST00000568120 430 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC126773.1-201ENST00000569654 547 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4682-201ENST00000580643 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 snoZ6.4-201ENST00000581669 55 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 FARSA-AS1-201ENST00000592636 241 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.5 ms