Protein–RNA interactions for Protein: V9GY05

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY05 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
V9GY05 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
V9GY05 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
V9GY05 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
V9GY05 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
V9GY05 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
V9GY05 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
V9GY05 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
V9GY05 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
V9GY05 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V9GY05 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GY05 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms