Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
U3KQE9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
U3KQE9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
U3KQE9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms