Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF3C3Q9Y5Q9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms