Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RAD54L2Q9Y4B4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RAD54L2Q9Y4B4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RAD54L2Q9Y4B4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RAD54L2Q9Y4B4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
RAD54L2Q9Y4B4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms